Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lca5Q80ST9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lca5Q80ST9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms