Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccp110Q7TSH4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccp110Q7TSH4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms