Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ShprhQ7TPQ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ShprhQ7TPQ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms