Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prrc2bQ7TPM1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrc2bQ7TPM1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrc2bQ7TPM1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms