Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Raver2Q7TPD6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Raver2Q7TPD6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms