Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smap2Q7TN29 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms