Protein–RNA interactions for Protein: Q791N7

Znrd1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrd1Q791N7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znrd1Q791N7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znrd1Q791N7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znrd1Q791N7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znrd1Q791N7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znrd1Q791N7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znrd1Q791N7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znrd1Q791N7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znrd1Q791N7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znrd1Q791N7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms