Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ScocQ78YZ6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScocQ78YZ6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms