Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim12Q78RX3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms