Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ncapd3Q6ZQK0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms