Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp34Q6ZQ93 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp34Q6ZQ93 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms