Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NinlQ6ZQ12 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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