Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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