Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ino80Q6ZPV2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ino80Q6ZPV2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms