Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf653Q6YND2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf653Q6YND2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms