Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pcp4l1Q6W8Q3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4l1Q6W8Q3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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