Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms