Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2eQ6VUP9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms