Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ift172Q6VH22 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms