Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja6Q6S5G4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms