Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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Tcaf3Q6QR59 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Tcaf3Q6QR59 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcaf3Q6QR59 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Tcaf3Q6QR59 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcaf3Q6QR59 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf3Q6QR59 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf3Q6QR59 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf3Q6QR59 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf3Q6QR59 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf3Q6QR59 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcaf3Q6QR59 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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