Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HjurpQ6PG16 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HjurpQ6PG16 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms