Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp40Q6PE01 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrnp40Q6PE01 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms