Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PD19 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PD19 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PD19 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6PD19 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6PD19 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6PD19 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PD19 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PD19 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6PD19 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms