Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhb9Q6PB60 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms