Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BcrQ6PAJ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcrQ6PAJ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms