Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slf2Q6P9P0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slf2Q6P9P0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slf2Q6P9P0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms