Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp2d40Q6P8N9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms