Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam222bQ6P539 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms