Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik3Q6P4S6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms