Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Slx4Q6P1D7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slx4Q6P1D7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms