Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pprc1Q6NZN1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pprc1Q6NZN1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms