Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZH9

Rasgrp3, RAS, guanyl-releasing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp3Q6NZH9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rasgrp3Q6NZH9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgrp3Q6NZH9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms