Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rprd2Q6NXI6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rprd2Q6NXI6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rprd2Q6NXI6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms