Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SphkapQ6NSW3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SphkapQ6NSW3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms