Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdcd11Q6NS46 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd11Q6NS46 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms