Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep78Q6IRU7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep78Q6IRU7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms