Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap20Q6IFT4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap20Q6IFT4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms