Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best3Q6H1V1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best3Q6H1V1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms