Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swap70Q6A028 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swap70Q6A028 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms