Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmcc1Q69ZZ6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmcc1Q69ZZ6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms