Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms