Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

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Length 1,940 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Kiaa1549Q68FD9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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Kiaa1549Q68FD9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Kiaa1549Q68FD9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Kiaa1549Q68FD9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Kiaa1549Q68FD9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Kiaa1549Q68FD9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kiaa1549Q68FD9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Kiaa1549Q68FD9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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