Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ino80dQ66JY2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ino80dQ66JY2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms