Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp9Q64HY3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Sp9Q64HY3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sp9Q64HY3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms