Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Top2bQ64511 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2bQ64511 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms