Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ccdc18Q640L5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc18Q640L5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
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