Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms