Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nptx1Q62443 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms