Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim28Q62318 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim28Q62318 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms